Нет, при заполнении анкеты на иммиграцию в Канаду через сайт национальный паспорт можно не указывать.
При этом он может потребоваться вам в пакете документов в том случае, если в каком-то документе есть ссылка на него.
Например, вы подтверждаете Proof of funds за счет денег с продажи автомобиля. Для этого нужно приложить договор купли-продажи. В договоре могут быть указаны данные вашего паспорта. В таком случае после договора лучше дополнительно приложить паспорт.